Source: Codon Usage Database (Feb 25, 2010)
Codon usage tabulated from the international DNA sequence databases: status for the year 2000. Nakamura, Y., Gojobori, T. and Ikemura, T. (2000) Nucl. Acids Res. 28, 292.

Arabidopsis thaliana

UUU 21.8(678320) UCU 25.2(782818) UAU 14.6(455089) UGU 10.5(327640)
UUC 20.7(642407) UCC 11.2(348173) UAC 13.7(427132) UGC 7.2(222769)
UUA 12.7(394867) UCA 18.3(568570) UAA 0.9( 29405) UGA 1.2( 36260)
UUG 20.9(649150) UCG 9.3(290158) UAG 0.5( 16417) UGG 12.5(388049)

CUU 24.1(750114) CCU 18.7(580962) CAU 13.8(428694) CGU 9.0(280392)
CUC 16.1(500524) CCC 5.3(165252) CAC 8.7(271155) CGC 3.8(117543)
CUA 9.9(307000) CCA 16.1(502101) CAA 19.4(604800) CGA 6.3(195736)
CUG 9.8(305822) CCG 8.6(268115) CAG 15.2(473809) CGG 4.9(151572)

AUU 21.5(668227) ACU 17.5(544807) AAU 22.3(693344) AGU 14.0(435738)
AUC 18.5(576287) ACC 10.3(321640) AAC 20.9(650826) AGC 11.3(352568)
AUA 12.6(391867) ACA 15.7(487161) AAA 30.8(957374) AGA 19.0(589788)
AUG 24.5(762852) ACG 7.7(240652) AAG 32.7(1016176) AGG 11.0(340922)

GUU 27.2(847061) GCU 28.3(880808) GAU 36.6(1139637) GGU 22.2(689891)
GUC 12.8(397008) GCC 10.3(321500) GAC 17.2(535668) GGC 9.2(284681)
GUA 9.9(308605) GCA 17.5(543180) GAA 34.3(1068012) GGA 24.2(751489)
GUG 17.4(539873) GCG 9.0(280804) GAG 32.2(1002594) GGG 10.2(316620)


Caenorhabditis elegans

UUU 23.3(260624) UCU 16.7(187184) UAU 17.5(195860) UGU 11.2(125864)
UUC 23.9(267710) UCC 10.6(118939) UAC 13.7(153317) UGC 9.1(101993)
UUA 9.8(110258) UCA 20.6(230820) UAA 1.6( 17653) UGA 1.4( 15994)
UUG 20.0(224208) UCG 12.2(136457) UAG 0.6( 7245) UGG 11.1(123925)

CUU 21.2(236968) CCU 8.8( 98666) CAU 14.1(158091) CGU 11.2(125440)
CUC 14.8(166037) CCC 4.4( 49300) CAC 9.2(102747) CGC 5.1( 57149)
CUA 7.9( 88086) CCA 26.1(292755) CAA 27.4(306929) CGA 12.1(135391)
CUG 12.1(135836) CCG 9.7(108479) CAG 14.4(160920) CGG 4.7( 52902)

AUU 32.2(360846) ACU 18.9(211659) AAU 30.2(337956) AGU 12.1(135726)
AUC 18.9(211592) ACC 10.4(115954) AAC 18.3(205008) AGC 8.4( 93596)
AUA 9.5(106074) ACA 20.0(224368) AAA 37.5(419559) AGA 15.4(172826)
AUG 26.1(292175) ACG 8.9( 99441) AAG 25.8(289397) AGG 4.0( 44270)

GUU 24.1(269560) GCU 22.4(250829) GAU 35.8(400841) GGU 10.9(122203)
GUC 13.6(151950) GCC 12.6(141585) GAC 17.1(191126) GGC 6.7( 74950)
GUA 9.8(109949) GCA 19.8(221831) GAA 40.8(457346) GGA 31.7(354969)
GUG 14.3(160677) GCG 8.2( 91816) GAG 24.5(274607) GGG 4.4( 49363)


Escherichia coli

UUU 24.4( 56791) UCU 13.1( 30494) UAU 21.6( 50400) UGU 5.9( 13662)
UUC 13.9( 32513) UCC 9.7( 22637) UAC 11.7( 27239) UGC 5.5( 12777)
UUA 17.4( 40627) UCA 13.1( 30502) UAA 2.0( 4664) UGA 1.1( 2674)
UUG 12.9( 30084) UCG 8.2( 19071) UAG 0.3( 751) UGG 13.4( 31207)

CUU 14.5( 33816) CCU 9.5( 22121) CAU 12.4( 28919) CGU 15.9( 37134)
CUC 9.5( 22074) CCC 6.2( 14379) CAC 7.3( 17117) CGC 14.0( 32720)
CUA 5.6( 12951) CCA 9.1( 21237) CAA 14.4( 33607) CGA 4.8( 11216)
CUG 37.4( 87261) CCG 14.5( 33795) CAG 26.7( 62329) CGG 7.9( 18434)

AUU 29.6( 68942) ACU 13.1( 30518) AAU 29.3( 68348) AGU 13.2( 30749)
AUC 19.4( 45213) ACC 18.9( 44139) AAC 20.3( 47233) AGC 14.3( 33255)
AUA 13.3( 31065) ACA 15.1( 35293) AAA 37.2( 86726) AGA 7.1( 16583)
AUG 23.7( 55356) ACG 13.6( 31794) AAG 15.3( 35652) AGG 4.0( 9238)

GUU 21.6( 50261) GCU 18.9( 44034) GAU 33.7( 78663) GGU 23.7( 55283)
GUC 13.1( 30515) GCC 21.6( 50411) GAC 17.9( 41619) GGC 20.6( 47962)
GUA 13.1( 30461) GCA 23.0( 53619) GAA 35.1( 81727) GGA 13.6( 31729)
GUG 19.9( 46309) GCG 21.1( 49169) GAG 19.4( 45154) GGG 12.3( 28720)


Macaca mulatta (Rhesus macaque)

UUU 18.1( 6235) UCU 15.6( 5373) UAU 13.1( 4507) UGU 10.3( 3533)
UUC 27.5( 9449) UCC 18.7( 6428) UAC 19.9( 6849) UGC 15.3( 5257)
UUA 5.6( 1941) UCA 10.6( 3655) UAA 0.6( 216) UGA 1.9( 642)
UUG 12.0( 4114) UCG 3.7( 1287) UAG 0.6( 216) UGG 17.8( 6130)

CUU 13.0( 4489) CCU 14.9( 5117) CAU 9.6( 3288) CGU 4.0( 1388)
CUC 24.9( 8562) CCC 18.6( 6400) CAC 15.3( 5273) CGC 9.9( 3422)
CUA 5.8( 2000) CCA 14.7( 5043) CAA 12.7( 4366) CGA 5.8( 2002)
CUG 44.6( 15349) CCG 5.9( 2028) CAG 33.6( 11572) CGG 10.6( 3663)

AUU 14.0( 4811) ACU 12.7( 4359) AAU 14.9( 5136) AGU 11.1( 3835)
AUC 27.6( 9509) ACC 23.6( 8114) AAC 21.4( 7371) AGC 17.9( 6170)
AUA 7.2( 2490) ACA 16.5( 5691) AAA 19.8( 6803) AGA 11.2( 3866)
AUG 21.7( 7477) ACG 6.3( 2156) AAG 28.9( 9944) AGG 13.2( 4543)

GUU 9.9( 3407) GCU 19.4( 6673) GAU 15.7( 5392) GGU 8.9( 3077)
GUC 18.1( 6219) GCC 26.6( 9157) GAC 24.1( 8295) GGC 20.4( 7007)
GUA 5.0( 1726) GCA 13.3( 4590) GAA 20.6( 7100) GGA 16.7( 5757)
GUG 33.9( 11655) GCG 7.4( 2542) GAG 39.2( 13474) GGG 17.2( 5921)


Mus musculus

UUU 17.2(422153) UCU 16.2(398250) UAU 12.2(298518) UGU 11.4(279729)
UUC 21.8(535439) UCC 18.1(444041) UAC 16.1(394074) UGC 12.3(301384)
UUA 6.7(165150) UCA 11.8(289799) UAA 1.0( 23403) UGA 1.6( 40148)
UUG 13.4(329668) UCG 4.2(103815) UAG 0.8( 19126) UGG 12.5(306619)

CUU 13.4(329757) CCU 18.4(450637) CAU 10.6(260637) CGU 4.7(114854)
CUC 20.2(495018) CCC 18.2(446868) CAC 15.3(375626) CGC 9.4(229758)
CUA 8.1(198032) CCA 17.3(423707) CAA 12.0(293318) CGA 6.6(161412)
CUG 39.5(969515) CCG 6.2(151521) CAG 34.1(836320) CGG 10.2(250836)

AUU 15.4(377698) ACU 13.7(335039) AAU 15.6(382284) AGU 12.7(311331)
AUC 22.5(552184) ACC 19.0(465115) AAC 20.3(499149) AGC 19.7(483013)
AUA 7.4(180467) ACA 16.0(391437) AAA 21.9(537723) AGA 12.1(297135)
AUG 22.8(559953) ACG 5.6(138180) AAG 33.6(825270) AGG 12.2(299472)

GUU 10.7(262535) GCU 20.0(491093) GAU 21.0(515049) GGU 11.4(280522)
GUC 15.4(377902) GCC 26.0(637878) GAC 26.0(638504) GGC 21.2(520069)
GUA 7.4(182733) GCA 15.8(388723) GAA 27.0(661498) GGA 16.8(411344)
GUG 28.4(696158) GCG 6.4(157124) GAG 39.4(965963) GGG 15.2(372099)


Rattus Norvegicus

UUU 16.5(115498) UCU 14.8(103148) UAU 11.6( 80999) UGU 9.8( 68418)
UUC 23.1(161568) UCC 17.8(124290) UAC 17.1(119192) UGC 11.9( 82751)
UUA 5.9( 41454) UCA 10.9( 76435) UAA 0.6( 4473) UGA 1.2( 8137)
UUG 12.8( 89203) UCG 4.4( 30458) UAG 0.5( 3637) UGG 13.2( 91958)

CUU 12.5( 87332) CCU 17.4(121358) CAU 9.5( 66664) CGU 5.0( 34788)
CUC 20.4(142093) CCC 18.0(125645) CAC 14.9(104027) CGC 9.8( 68486)
CUA 7.6( 52955) CCA 16.1(112364) CAA 11.1( 77366) CGA 6.8( 47207)
CUG 41.1(286626) CCG 6.3( 43713) CAG 33.8(235764) CGG 10.9( 76123)

AUU 15.3(106736) ACU 12.9( 90372) AAU 15.1(105212) AGU 11.8( 82659)
AUC 24.4(170096) ACC 19.7(137673) AAC 21.7(151564) AGC 19.2(133954)
AUA 6.9( 48257) ACA 15.3(106544) AAA 21.5(150018) AGA 11.2( 77965)
AUG 23.1(161552) ACG 6.2( 43237) AAG 35.1(245259) AGG 11.8( 82391)

GUU 10.4( 72270) GCU 19.7(137491) GAU 20.9(146211) GGU 11.4( 79443)
GUC 16.2(113143) GCC 27.1(189524) GAC 28.0(195508) GGC 21.9(152582)
GUA 7.2( 50048) GCA 15.6(109203) GAA 26.9(187810) GGA 16.6(115968)
GUG 30.0(209458) GCG 6.9( 47869) GAG 41.3(288345) GGG 15.6(108657)


Saccharomyces cerevisiae

UUU 26.1(170666) UCU 23.5(153557) UAU 18.8(122728) UGU 8.1( 52903)
UUC 18.4(120510) UCC 14.2( 92923) UAC 14.8( 96596) UGC 4.8( 31095)
UUA 26.2(170884) UCA 18.7(122028) UAA 1.1( 6913) UGA 0.7( 4447)
UUG 27.2(177573) UCG 8.6( 55951) UAG 0.5( 3312) UGG 10.4( 67789)

CUU 12.3( 80076) CCU 13.5( 88263) CAU 13.6( 89007) CGU 6.4( 41791)
CUC 5.4( 35545) CCC 6.8( 44309) CAC 7.8( 50785) CGC 2.6( 16993)
CUA 13.4( 87619) CCA 18.3(119641) CAA 27.3(178251) CGA 3.0( 19562)
CUG 10.5( 68494) CCG 5.3( 34597) CAG 12.1( 79121) CGG 1.7( 11351)

AUU 30.1(196893) ACU 20.3(132522) AAU 35.7(233124) AGU 14.2( 92466)
AUC 17.2(112176) ACC 12.7( 83207) AAC 24.8(162199) AGC 9.8( 63726)
AUA 17.8(116254) ACA 17.8(116084) AAA 41.9(273618) AGA 21.3(139081)
AUG 20.9(136805) ACG 8.0( 52045) AAG 30.8(201361) AGG 9.2( 60289)

GUU 22.1(144243) GCU 21.2(138358) GAU 37.6(245641) GGU 23.9(156109)
GUC 11.8( 76947) GCC 12.6( 82357) GAC 20.2(132048) GGC 9.8( 63903)
GUA 11.8( 76927) GCA 16.2(105910) GAA 45.6(297944) GGA 10.9( 71216)
GUG 10.8( 70337) GCG 6.2( 40358) GAG 19.2(125717) GGG 6.0( 39359)